ある夜カイトは夢で、フリーセルと彼の母親の形見であるペンダントを持つノノハの姿を見た。カイトは、それが自分が以前オルペウスの腕輪の影響で見ていた｢未来の光景｣...

自分たちのオルペウス・リングがレプリカであることを知ったミゼルカとダウトは、自らの存在意義をかけてカイトにパズル・バトルを申し出た。戸惑うカイトたちの前にバ...

POGジャパンがオルペウス・オーダーに占拠された！メランコリィとホイストは、カイトに｢捕らわれたフリーセルを救いたければ、ゲームの舞台へ来い｣と告げる。それは、オ...

軸川ソウジが、√学園に戻ってきた！オルペウス・オーダーの調査をしていたソウジは、持ち帰った一冊の日記をカイトたちに見せる。その日記に書かれた、フリーセルの母親...

｢神のパズルで待ってる｣カイトにそう言い残し、再び姿を消したフリーセル。そして……ノノハまで連れ去られてしまった！何の手がかりもなくいらだつカイトの元に、ホイス...

フリーセルが、カイトと遊ぶために用意した｢神のパズル｣。それは、2人のパズルタイムを永遠に続けられる｢閉じた世界｣へといざなうパズルだった。思考を限界まで加速させ...

ピノクルが単身√(ルート)学園に乗り込んできた。互いの命を賭けたゲームを申し込み、カイトが勝ったらすべてを教えるというピノクル。白熱するゲームの最中、ピノクルは...

アナのアトリエがある第2美術室に現れた謎の女性。それは、アナの姉・イヴだった。久々の再会を喜ぶアナ。しかし、優しかったはずの姉は、変貌していた――。オルペウス・...

謹慎していたフリーセルたち5人の前に、新たな指揮官が着任。それは、ルークによってPOGから追放された、ヘルベルト・ミューラーだった。そして彼の手には、｢ファイ・ブ...

レプリカリングを装着したソウジが、自作のパズルでカイトにバトルを挑む。リングの力に飲まれてはいないと断言するソウジ。カイトはそのことばを信じきれないまま、勝...

突然、ソウジが生徒会長とパズル部の部長を辞めるという。理由もよく分からず皆が混乱する中、キュービックだけが浮かない顔をしている。実は、ソウジはオルペウス・オ...

オルペウスの腕輪の力によって感情が暴走し、パズルが解けなくなってしまった大門カイト。そこへ新たなギヴァー、鬼の手姫からの招待状が届く。しかし、カイトは招待状...

ビショップという男の案内でPOGの研究施設へ向かったカイトたち。POGジャパンの総責任者が、カイトとの対面を望んでいるというのだ。だが、施設で彼らを迎えたのは3つの...

ソウジの依頼を受けて、｢ダ・ヴィンチ｣の称号を持つアナ・グラムと一緒に風景画家の家で｢賢者のパズル｣を解くことになったカイト。危険なパズルに他人を巻き込みたくな...

｢エジソン｣の称号を持つ天才中学生、キュービック・G(ガロア)は、カイトの才能に興味を持ち、人に役立つ共同研究をしようと誘ってくる。だが、パズルにしか興味のないカ...

カイトの前に、｢ガリレオ｣の称号を持つ逆之上ギャモンが現れた。｢俺の頭脳は金になる｣というポリシーでパズルを解いているギャモンは、自分の狙った財を解放してしまっ...

√(ルート)学園高等部1年生・大門カイトは、ミノタウロスという謎のギヴァー(出題者)から｢賢者のパズル｣への招待状を受け取る。解くのに失敗すれば死ぬかもしれない、危...

戻ってきたルークがカイトたちに託したのは、オルペウス・オーダーによって開発された、新型のレプリカリングだった。その帰り道、突然現れたメランコリィが、ルークと...

連戦で疲れきったカイトたちを、南の島にあるPOGの豪華別荘へと招待するエレナ。ただし、島に滞在中は｢パズル禁止｣と言い渡す。海で遊ぶのにすぐに飽きてしまい、パズル...

ギャモンは、第4回戦と最終戦を合わせたカイト&ギャモンVSフリーセル&ダウトのタッグマッチを申し出る。カイトのフォローをしようとするギャモンだが、フリーセ...

アナVSミゼルカによる｢リンク・スライダー｣第3回戦。フリーセルの過去をピノクルに告げられたカイトはショックを隠せなかった。そんな彼に笑顔を取り戻してほしいと、ア...

さまざまな謎を明らかにするため、バロンに会いに行くカイト。だがバロンは、カイトたちがイギリスにいる間に行方不明になってしまっていた。そんなとき、カイトの携帯...

｢教えてやるよ。月も太陽も俺様を中心に回ってるってことをな！｣POGの追っ手を回避するためイタリアにやってきたカイトたち。元気のないキュービックとカイトをよそに、...

キュービックがPOGに襲われたと知ったカイトは、ルークの手がかりを求めてクロスフィールド学院の研究施設へと向かう。一方アナは不思議な声に導かれ、カイトとルークの...

キュービックの元に暗号が届く。それはPOGからのメッセージだった。カイトと一緒にいるのにふさわしいのは誰なのか教えてやる、とルークに対して闘志を燃やすキュービッ...

わなに追い立てられながら、愚者のパズルの塔を上り続けるカイト。その途中、姿が消えていたルークが倒れているのを発見する。塔から脱出するためには、自分を見捨てて...

9年ぶりに親友・ルークと再会を果たしたカイトは、イギリスの名門校・クロスフィールド学院に短期留学することになった。思い出の場所を散策していたふたりは、青年Xと...

姫川エレナ主演の特撮番組に招待されて出演することになったカイトたち。だが、パズルをただの道具として考えるエレナとカイトは意見が合わない。そして、再びパズル・...

アントワネットの称号を持つアイドル、姫川エレナから挑戦を受けるカイト。エレナはヘルベルトから、仲間もろともカイトを排除しろという命令を受けていた。仲間なんて...

学園祭が始まった。ノノハは部活の屋台や出し物の手伝いに大忙し。一方、アナは個展、キュービックは発明発表会、そしてカイトとギャモンは学園祭の目玉｢ミス・ルートボ...

パズル王・ジーニアス奥寺に誘われて、リニューアルオープンを控えたリゾートホテル｢パズル・イン・リゾート｣を訪れたカイトたち。そのホテルは、支配人の祖父が残した...

√幼稚園の先生、搭野マドカがこっそりカイトに手紙を渡しているのを見てしまったノノハ。キュービックやアナは｢ラブレターでは？｣とはやし立てるが、カイトはそれを否定...